Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- d -

• D : CMESolver, lm::cme::CMESolver
• d_overflows : lm::rdme::gpu_worker_thread_int_params, lm::rdme::gpu_worker_thread_params, lm::rdme::MPIMpdRdmeSolver
• data : lm::main::DataOutputQueue::DataSet
• dataMutex : lm::main::DataOutputQueue
• DataOutputQueue() : lm::main::DataOutputQueue
• dataQueue : lm::main::DataOutputQueue
• DATASET : H5Lookup
• DataSet() : lm::main::DataOutputQueue::DataSet
• dataSet : CMESolver::FPTTracking, CMESolver::TrackedParameter, lm::cme::CMESolver::FPTTracking, lm::cme::CMESolver::TrackedParameter
• dc : jLM.RDME.File, jLM.RDME.Sim
• deallocateCudaMemory() : CudaByteLattice, CudaByteLatticeExtended, lm::rdme::CudaByteLattice, lm::rdme::CudaByteLatticeExtended, lm::rdme::CudaIntLattice
• deallocateMemory() : lm::rdme::ByteLattice, lm::rdme::IntLattice
• DEBUG : lm::Print, Print
• defaultDiffusionRate : pyLM.RDME.RDMERegion
• definedRegions : lm::builder::LatticeBuilder
• defineSpecies() : jLM.CME.CMESimulation, pyLM.CME.CMESimulation, pyLM.RDME.RDMESimulation
• dependent_pos : gpu_info
• dependentReactions : CMESolver, lm::cme::CMESolver
• dependentSpecies : CMESolver, lm::cme::CMESolver
• dependentSpeciesChange : CMESolver, lm::cme::CMESolver
• depth : lm::builder::Cuboid, pySTDLM.Cells.BoxCell
• descriptor : MultiGPUMapper
• destroyDiffusionModel() : lm::rdme::NextSubvolumeSolver, lm::rdme::RDMESolver, RDMESolver
• destroyModel() : CMESolver, lm::cme::CMESolver, lm::cme::FluctuatingNRSolver, lm::cme::GillespieDSolver, lm::cme::NextReactionSolver, lm::rdme::NextSubvolumeSolver
• determinant() : lm::builder::matrix
• determine_load_balance() : MultiGPUMapper, ZDivMultiGPUMapper
• device_id : MultiGPUMapper
• device_memory : MultiGPUMapper
• deviceReactionLocationMatrix : lm::MpdRdmeSolverExtended
• deviceReactionMatrix : lm::MpdRdmeSolverExtended
• DF : lm::rdme::RDMESolver, RDMESolver
• DIFFERENCE : lm::builder::Shape
• Difference() : lm::builder::Difference
• diffRateList : jLM.JupyterDisplay.JupyterDisplayMixin, jLM.LmInteract.LmWriteMixin, jLM.RDME.File, jLM.RDME.Sim, jLM.RDME.SpatialModel
• diffusion_finished : lm::rdme::MPIMpdRdmeSolver, segmentDescriptor
• diffusionConst() : jLM.RDME.SpatialModel
• diffusionFast() : jLM.RDME.SpatialModel
• diffusionModel : lm::main::ReplicateRunner, ReplicateRunner
• diffusionRate() : jLM.Types.BuilderRegion, jLM.Types.BuilderSpecies, pyLM.RDME.RDMERegion
• diffusionZero() : jLM.RDME.SpatialModel
• dilate() : jLM.RegionBuilder.RegionBuilder
• discretizeObstaclesTo() : lm::builder::LatticeBuilder
• discretizeTo() : lm::builder::LatticeBuilder, lm::builder::Shape
• displayGeometry() : jLM.JupyterDisplay.JupyterDisplayMixin
• distance() : lm::builder::point
• distanceSquared() : lm::builder::point
• distribute_concentration_safe() : jLM.ParticleSizeSupport.ParticleSizeMixin
• distribute_number_safe() : jLM.ParticleSizeSupport.ParticleSizeMixin
• distributeConcentration() : jLM.RDME.SpatialModel, jLM.RDMEExtended.SimExtended
• distributeNumber() : jLM.RDME.SpatialModel, jLM.RDMEExtended.SimExtended
• Distributions : lm::rng::RandomGenerator, RandomGenerator
• dists : jLM.Solvers.ConstBoundaryConc
• distTable : jLM.Solvers.ConstBoundaryConc
• dk : CMESolver::KHillTransportPropensityArgs, lm::cme::CMESolver::KHillTransportPropensityArgs, lm::cme::SelfRegulatingGeneSwitch::OUKHillPropensityArgs, lm::cme::TwoStateHillSwitch::KHillPropensityArgs
• dLattice : lm::rdme::gpu_worker_thread_int_params, lm::rdme::gpu_worker_thread_params, lm::rdme::MPIMpdRdmeSolver
• dLatticeTmp : lm::rdme::gpu_worker_thread_int_params, lm::rdme::gpu_worker_thread_params, lm::rdme::MPIMpdRdmeSolver
• do_blockquote() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_bold() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_compounddef() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_computeroutput() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_doxygenindex() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_emphasis() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_header() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_heading() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_hruler() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_includes() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_itemizedlist() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_linebreak() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_listitem() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_mdash() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_member() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_memberdef() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_ndash() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_orderedlist() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_para() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_parameterdescription() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_parameteritem() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_parameterlist() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_parametername() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_parameternamelist() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_sectiondef() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_simplesect() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• do_verbatim() : doxy2swig.Doxy2SWIG
• doesIntersect() : pySTDLM.CellArranger.RandomArranger
• dot() : lm::builder::vector
• dSites : lm::rdme::gpu_worker_thread_int_params, lm::rdme::gpu_worker_thread_params, lm::rdme::MPIMpdRdmeSolver